Morphological and molecular identification of Holothuria (Merthensiothuria) leucospilota and Stichopus horrens from Pangkor Island, Malaysia

Kajian awal ini bertujuan untuk mengenalpasti satu spesies komersil gamat iaitu Stichopus horrens Selenka, 1867 dan satu spesies timun laut iaitu Holothuria (Mertensiothuria) leucospilota (Brandt, 1835) dari Pulau Pangkor, Perak, Malaysia dengan mengaplikasikan teknik-teknik morfologi berdasarkan be...

Full description

Bibliographic Details
Main Authors: Kamarudin, Kamarul Rahim, Mohamed Rehan, Maryam
Format: Article
Language:English
Published: Penerbit Universiti Sains Malaysia 2015
Subjects:
Online Access:http://eprints.uthm.edu.my/5791/
http://eprints.uthm.edu.my/5791/1/AJ%202015%20%2854%29.pdf
_version_ 1848888635309424640
author Kamarudin, Kamarul Rahim
Mohamed Rehan, Maryam
author_facet Kamarudin, Kamarul Rahim
Mohamed Rehan, Maryam
author_sort Kamarudin, Kamarul Rahim
building UTHM Institutional Repository
collection Online Access
description Kajian awal ini bertujuan untuk mengenalpasti satu spesies komersil gamat iaitu Stichopus horrens Selenka, 1867 dan satu spesies timun laut iaitu Holothuria (Mertensiothuria) leucospilota (Brandt, 1835) dari Pulau Pangkor, Perak, Malaysia dengan mengaplikasikan teknik-teknik morfologi berdasarkan bentuk-bentuk osikel dan teknik-teknik molekul menggunakan gen sitokrom c osidasi I (COI) mitokondria DNA (mtDNA). Di Malaysia, gamat didefinisikan sebagai spesies timun laut daripada famili Stichopodidae yang memiliki nilai-nilai perubatan manakala timun laut dirujukkan kepada spesies bukan gamat. Spesies S. horrens adalah amat popular di Pulau Pangkor sebagai bahan utama dalam penghasilan air gamat dan minyak gamat secara tradisional manakala H. leucospilota merupakan spesies paling dominan di Malaysia. Berbeza dengan kajian-kajian sebelum ini, bahagian dalaman tubuh iaitu pohon respirasi dan gastrousus telah disertakan dalam kajian ini untuk mendapatkan kesimpulan yang lebih baik berdasarkan morfologi. Keputusan-keputusan menunjukkan tiada osikel telah hadir di dalam gastrousus H. leucospilota dan ciri tersebut dicadangkan sebagai penanda diagnostik yang unik untuk spesies timun laut tersebut. Di samping itu, kehadiran rod berbentuk Y di dalam pohon respirasi S. horrens seterusnya menyokong potensi bahagian dalaman tubuh untuk mengenalpasti spesies gamat tersebut. Selanjutnya, analisis-analisis filogenetik gen COI mtDNA spesimen-spesimen timun laut tersebut menggunakan kaedah hubungkait jiran dan kaedah persamaan maksimum seterusnya mengesahkan status spesies H. leucospilota dan S. horrens dari Pulau Pangkor, Perak, Malaysia. Jujukan-jujukan gen COI mtDNA tersebut telah didaftarkan dengan GenBank, National Center for Biotechnology Information (NCBI), US National Library of Medicine (no. akses GenBank: KC405565-KC405568). Walaupun lebih banyak spesimen dari pelbagai lokasi diperlukan untuk menghasilkan keputusan-keputusan muktamad yang lebih baik, penemuan-penemuan semasa telah memberi gambaran yang lebih baik tentang kepentingan pendekatan-pendekatan yang saling lengkap-melengkapi iaitu teknik-teknik morfologi dan molekul dalam pengenalpastian kedua-dua spesies timun laut Malaysia tersebut.
first_indexed 2025-11-15T20:13:25Z
format Article
id uthm-5791
institution Universiti Tun Hussein Onn Malaysia
institution_category Local University
language English
last_indexed 2025-11-15T20:13:25Z
publishDate 2015
publisher Penerbit Universiti Sains Malaysia
recordtype eprints
repository_type Digital Repository
spelling uthm-57912022-01-23T07:01:31Z http://eprints.uthm.edu.my/5791/ Morphological and molecular identification of Holothuria (Merthensiothuria) leucospilota and Stichopus horrens from Pangkor Island, Malaysia Kamarudin, Kamarul Rahim Mohamed Rehan, Maryam T Technology (General) Kajian awal ini bertujuan untuk mengenalpasti satu spesies komersil gamat iaitu Stichopus horrens Selenka, 1867 dan satu spesies timun laut iaitu Holothuria (Mertensiothuria) leucospilota (Brandt, 1835) dari Pulau Pangkor, Perak, Malaysia dengan mengaplikasikan teknik-teknik morfologi berdasarkan bentuk-bentuk osikel dan teknik-teknik molekul menggunakan gen sitokrom c osidasi I (COI) mitokondria DNA (mtDNA). Di Malaysia, gamat didefinisikan sebagai spesies timun laut daripada famili Stichopodidae yang memiliki nilai-nilai perubatan manakala timun laut dirujukkan kepada spesies bukan gamat. Spesies S. horrens adalah amat popular di Pulau Pangkor sebagai bahan utama dalam penghasilan air gamat dan minyak gamat secara tradisional manakala H. leucospilota merupakan spesies paling dominan di Malaysia. Berbeza dengan kajian-kajian sebelum ini, bahagian dalaman tubuh iaitu pohon respirasi dan gastrousus telah disertakan dalam kajian ini untuk mendapatkan kesimpulan yang lebih baik berdasarkan morfologi. Keputusan-keputusan menunjukkan tiada osikel telah hadir di dalam gastrousus H. leucospilota dan ciri tersebut dicadangkan sebagai penanda diagnostik yang unik untuk spesies timun laut tersebut. Di samping itu, kehadiran rod berbentuk Y di dalam pohon respirasi S. horrens seterusnya menyokong potensi bahagian dalaman tubuh untuk mengenalpasti spesies gamat tersebut. Selanjutnya, analisis-analisis filogenetik gen COI mtDNA spesimen-spesimen timun laut tersebut menggunakan kaedah hubungkait jiran dan kaedah persamaan maksimum seterusnya mengesahkan status spesies H. leucospilota dan S. horrens dari Pulau Pangkor, Perak, Malaysia. Jujukan-jujukan gen COI mtDNA tersebut telah didaftarkan dengan GenBank, National Center for Biotechnology Information (NCBI), US National Library of Medicine (no. akses GenBank: KC405565-KC405568). Walaupun lebih banyak spesimen dari pelbagai lokasi diperlukan untuk menghasilkan keputusan-keputusan muktamad yang lebih baik, penemuan-penemuan semasa telah memberi gambaran yang lebih baik tentang kepentingan pendekatan-pendekatan yang saling lengkap-melengkapi iaitu teknik-teknik morfologi dan molekul dalam pengenalpastian kedua-dua spesies timun laut Malaysia tersebut. Penerbit Universiti Sains Malaysia 2015 Article PeerReviewed text en http://eprints.uthm.edu.my/5791/1/AJ%202015%20%2854%29.pdf Kamarudin, Kamarul Rahim and Mohamed Rehan, Maryam (2015) Morphological and molecular identification of Holothuria (Merthensiothuria) leucospilota and Stichopus horrens from Pangkor Island, Malaysia. Tropical Life Sciences Research, 26 (1). pp. 87-99. ISSN 1985-3718
spellingShingle T Technology (General)
Kamarudin, Kamarul Rahim
Mohamed Rehan, Maryam
Morphological and molecular identification of Holothuria (Merthensiothuria) leucospilota and Stichopus horrens from Pangkor Island, Malaysia
title Morphological and molecular identification of Holothuria (Merthensiothuria) leucospilota and Stichopus horrens from Pangkor Island, Malaysia
title_full Morphological and molecular identification of Holothuria (Merthensiothuria) leucospilota and Stichopus horrens from Pangkor Island, Malaysia
title_fullStr Morphological and molecular identification of Holothuria (Merthensiothuria) leucospilota and Stichopus horrens from Pangkor Island, Malaysia
title_full_unstemmed Morphological and molecular identification of Holothuria (Merthensiothuria) leucospilota and Stichopus horrens from Pangkor Island, Malaysia
title_short Morphological and molecular identification of Holothuria (Merthensiothuria) leucospilota and Stichopus horrens from Pangkor Island, Malaysia
title_sort morphological and molecular identification of holothuria (merthensiothuria) leucospilota and stichopus horrens from pangkor island, malaysia
topic T Technology (General)
url http://eprints.uthm.edu.my/5791/
http://eprints.uthm.edu.my/5791/1/AJ%202015%20%2854%29.pdf