Comprehensivemolecular characterization of clear cell renal cell carcinoma

Genetic changes underlying clear cell renal cell carcinoma(ccRCC) include alterations in genes controlling cellularoxygen sensing (for example, VHL) and the maintenance of chromatin states (for example, PBRM1). We surveyed more than 400 tumours using different genomic platforms and identified 19 sig...

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Bibliographic Details
Main Authors:	Creighton, C., Morgan, M., Gunaratne, P., Wheeler, D., Gibbs, R., Robertson, A., Chu, A., Beroukhim, R., Cibulskis, K., Signoretti, S., Vandin, F., Wu, H., Raphael, B., Verhaak, R., Tamboli, P., Torres-Garcia, W., Akbani, R., Weinstein, J., Reuter, V., Hsieh, J., Brannon, A., Hakimi, A., Jacobsen, A., Ciriello, G., Reva, B., Ricketts, C., Linehan, W., Stuart, J., Rathmell, W., Shen, H., Laird, P., Muzny, D., Davis, C., Xi, L., Chang, K., Kakkar, N., Trevino, L., Benton, S., Reid, J., Morton, D., Doddapaneni, H., Han, Y., Lewis, L., Dinh, H., Kovar, C., Zhu, Y., Santibanez, J., Wang, M., Hale, W., Kalra, D., Getz, G., Lawrence, M., Sougnez, C., Carter, S., Sivachenko, A., Lichtenstein, L., Stewart, C., Voet, D., Fisher, S., Gabriel, S., Lander, E., Schumacher, S., Tabak, B., Saksena, G., Onofrio, R., Cherniack, A., Gentry, J., Ardlie, K., Meyerson, M., Chun, H., Mungall, A., Sipahimalani, P., Stoll, D., Ally, A., Balasundaram, M., Butterfield, Y., Carlsen, R., Carter, C., Chuah, E., Coope, R., Dhalla, N., Gorski, S., Guin, R., Hirst, C., Hirst, M., Holt, R., Lebovitz, C., Lee, D., Li, H., Mayo, M., Moore, R., Pleasance, E., Plettner, P., Schein, J., Shafiei, A., Slobodan, J., Tam, A., Thiessen, N., Varhol, Richard, Wye, N., Zhao, Y., Birol, I., Jones, S., Marra, M., Auman, J., Tan, D., Jones, C., Hoadley, K., Mieczkowski, P., Mose, L., Jefferys, S., Topal, M., Liquori, C., Turman, Y., Shi, Y., Waring, S., Buda, E., Walsh, J., Wu, J., Bodenheimer, T., Hoyle, A., Simons, J., Soloway, M., Balu, S., Parker, J., Hayes, D., Perou, C., Kucherlapati, R., Park, P., Triche, T., Weisenberger, D., Lai, P., Bootwalla, M., Maglinte, D., Mahurkar, S., Berman, B., Van den Berg, D., Cope, L., Baylin, S., Noble, M., DiCara, D., Zhang, H., Cho, J., Heiman, D., Gehlenborg, N., Mallard, W., Lin, P., Frazer, S., Stojanov, P., Liu, Y., Zhou, L., Kim, J., Chin, L., Benz, C., Yau, C., Reynolds, S., Shmulevich, I., Vegesna, R., Kim, H., Zhang, W., Cogdell, D., Jonasch, E., Ding, Z., Lu, Y., Zhang, N., Unruh, A., Casasent, T., Wakefield, C., Tsavachidou, D., Mills, G., Schultz, N., Antipin, Y., Gao, J., Cerami, E., Gross, B., Aksoy, B., Sinha, R., Weinhold, N., Sumer, S., Taylor, B., Shen, R., Ostrovnaya, I., Berger, M., Ladanyi, M., Sander, C., Fei, S., Stout, A., Spellman, P., Rubin, D., Liu, T., Sam, N., Paull, E., Carlin, D., Goldstein, T., Waltman, P., Ellrott, K., Zhu, J., Haussler, D., Xiao, W., Shelton, C., Gardner, J., Penny, R., Sherman, M., Mallery, D., Morris, S., Paulauskis, J., Burnett, K., Shelton, T., Kaelin, W., Choueiri, T., Atkins, M., Curley, E., Tickoo, S., Thorne, L., Boice, L., Huang, M., Fisher, J., Vocke, C., Peterson, J., Worrell, R., Merino, M., Schmidt, L., Czerniak, B., Aldape, K., Wood, C., Boyd, J., Weaver, J., Iacocca, M., Petrelli, N., Witkin, G., Brown, J., Czerwinski, C., Huelsenbeck-Dill, L., Rabeno, B., Myers, J., Morrison, C., Bergsten, J., Eckman, J., Harr, J., Smith, C., Tucker, K., Zach, L., Bshara, W., Gaudioso, C., Dhir, R., Maranchie, J., Nelson, J., Parwani, A., Potapova, O., Fedosenko, K., Cheville, J., Thompson, R., Mosquera, J., Rubin, M., Blute, M., Pihl, T., Jensen, M., Sfeir, R., Kahn, A., Kothiyal, P., Snyder, E., Pontius, J., Ayala, B., Backus, M., Walton, J., Baboud, J., Berton, D., Nicholls, M., Srinivasan, D., Raman, R., Girshik, S., Kigonya, P., Alonso, S., Sanbhadti, R., Barletta, S., Pot, D., Sheth, M., Demchok, J., Davidsen, T., Wang, Z., Yang, L., Tarnuzzer, R., Zhang, J., Eley, G., Ferguson, M., Shaw, K., Guyer, M., Ozenberger, B., Sofia, H.
Format:	Journal Article
Published:	Nature Publishing Group 2013
Online Access:	http://hdl.handle.net/20.500.11937/66477